More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1868 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  100 
 
 		 375 aa  757    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  47.01 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  48.04 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  42.26 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  45.55 
 
 		 374 aa  276  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  39.62 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  42.29 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  39.12 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 		 396 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  34.77 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  31.84 
 
 		 357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  33.04 
 
 		 358 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  26.26 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 666 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  46.28 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 378 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 392 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 374 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 		 747 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  23.4 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.47 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  25.3 
 
 		 797 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0955  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.29 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  26.81 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 763 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.41 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.68 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 		 759 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  34.39 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  28.51 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>