More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1137 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  100 
 
 		 281 aa  577  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  60.93 
 
 		 278 aa  349  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  60.29 
 
 		 278 aa  341  8e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  58.74 
 
 		 298 aa  338  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  59.85 
 
 		 285 aa  322  6e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  60.8 
 
 		 278 aa  320  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  65.58 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  42.23 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  43.61 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  39.22 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  42.02 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  42.46 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  41.41 
 
 		 308 aa  168  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  41.33 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  40.8 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  40.78 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  46.23 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  39.27 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  41.26 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  34.01 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  43.48 
 
 		 360 aa  155  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  33.68 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  40.68 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  40.24 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  35.69 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  42.79 
 
 		 386 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  37.2 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  37.88 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  35.66 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  36.93 
 
 		 315 aa  141  9e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  42 
 
 		 381 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  38.32 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  40.71 
 
 		 333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  41.5 
 
 		 381 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  40.21 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  37.27 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  39.42 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.94 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  40.36 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  40.54 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  41.36 
 
 		 362 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.08 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  41.62 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  39.38 
 
 		 435 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 		 370 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  41.62 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  41.62 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  39.13 
 
 		 388 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.41 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 		 370 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  35.81 
 
 		 381 aa  135  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  40.39 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  39.04 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  39.91 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  42.54 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  35.45 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1607  A/G-specific adenine glycosylase  39.91 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.3 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  39.9 
 
 		 355 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  39.27 
 
 		 353 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  41.58 
 
 		 353 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  39.9 
 
 		 355 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  35.27 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  37.72 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  37.72 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  37.72 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  37.72 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  37.72 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  37.72 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  37.72 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.78 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.92 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  43.16 
 
 		 357 aa  132  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  34.43 
 
 		 363 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  39.9 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.92 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  37.13 
 
 		 407 aa  130  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.78 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  35.16 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  41.48 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  38.62 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  34.67 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  39.58 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  35.64 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  36.04 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  39.9 
 
 		 362 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  32.97 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  37.17 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  31.9 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  41.34 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  34.19 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.34 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.63 
 
 		 357 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  36.9 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.33 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  35.66 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  38.79 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>