More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0425 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  267  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  73.15 
 
 		 111 aa  174  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  75.25 
 
 		 111 aa  165  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  67.92 
 
 		 113 aa  159  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  67.27 
 
 		 111 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  70.87 
 
 		 113 aa  158  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  68.27 
 
 		 111 aa  158  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  45.68 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 109 aa  87.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  41.56 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  37.36 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  37.25 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  43.33 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  40 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 107 aa  50.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  33.67 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  32.86 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  40.24 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.03 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  33.02 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  31.03 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  42.03 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 		 105 aa  47.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>