More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7844 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.56 
 
 		 242 aa  251  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0860852  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.61 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00973208  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  50.61 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2504  glucose-1-dehydrogenase  51.01 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  50.61 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  54.96 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1482  glucose 1-dehydrogenase  47.35 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.350696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2158  glucose 1-dehydrogenase  47.35 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  53.88 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  53.88 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.858408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  54.13 
 
 		 253 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2313  glucose-1-dehydrogenase  53.72 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5602  glucose-1-dehydrogenase  54.13 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  45.75 
 
 		 248 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3547  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.99 
 
 		 248 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.765075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0397  oxidoreductase  48.37 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  53.31 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1035  glucose-1-dehydrogenase  53.72 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.05 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195415  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0371739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.74 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0871917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  48.58 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124334  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3321  hypothetical protein  44.49 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.78 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2758  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  46.96 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0263508  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 		 248 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0908582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2487  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147298  normal  0.672807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2526  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00539118  normal  0.224466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  48.18 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2368  glucose-1-dehydrogenase  46.56 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.445485  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2772  glucose-1-dehydrogenase  46.56 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2032  glucose-1-dehydrogenase  51.01 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal  0.784384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1253  glucose-1-dehydrogenase  51.24 
 
 		 247 aa  201  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  44.26 
 
 		 243 aa  201  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06849  hypothetical protein  45.31 
 
 		 243 aa  201  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1270  glucose-1-dehydrogenase  52.24 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151441  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1263  glucose-1-dehydrogenase  52.24 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.859357  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1859  glucose-1-dehydrogenase  52.24 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0386  glucose-1-dehydrogenase  52.24 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0763  glucose-1-dehydrogenase  52.24 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1103  glucose-1-dehydrogenase  52.24 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1408  glucose-1-dehydrogenase  51.84 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2688  putative short-chain dehydrogenase/reductase  45.27 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3141  short chain dehydrogenase  47.77 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185736  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  45.12 
 
 		 253 aa  194  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0012  putative short-chain dehydrogenase  44.03 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891592 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0254  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.818245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139142  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0807  hypothetical protein  42.86 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.540927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02734  predicted NAD(P)-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  42.45 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3061  hypothetical protein  42.45 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3229  hypothetical protein  42.45 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02697  hypothetical protein  42.45 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.580093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3323  hypothetical protein  42.04 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 247 aa  180  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.994157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.88009  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3527  oxidoreductase  43.78 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 		 245 aa  171  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0185509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0396102  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 300 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  36.07 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  36.9 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.55 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.612253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>