58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7704 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7704  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 
216 aa  434  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8299  hypothetical protein  51.11 
 
 
181 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4402  protein of unknown function DUF1470  52.22 
 
 
183 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3685  protein of unknown function DUF1470  46.15 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2901  hypothetical protein  47.22 
 
 
175 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0544322  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3946  hypothetical protein  41.48 
 
 
175 aa  128  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.839426  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0408  hypothetical protein  36.31 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0341  hypothetical protein  41.41 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5759  hypothetical protein  34.88 
 
 
178 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7774  hypothetical protein  36.56 
 
 
189 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1581  hypothetical protein  42.55 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.345604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  35.34 
 
 
192 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0451  protein of unknown function DUF1470  43.81 
 
 
177 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6164  hypothetical protein  39.2 
 
 
195 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16944  hitchhiker  0.00195303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5293  protein of unknown function DUF1470  39.69 
 
 
183 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  40.98 
 
 
182 aa  85.9  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4083  protein of unknown function DUF1470  38.46 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2338  hypothetical protein  34.36 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1406  protein of unknown function DUF1470  31.18 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0606124  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4103  hypothetical protein  35.5 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2620  protein of unknown function DUF1470  42.19 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000174145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2309  protein of unknown function DUF1470  34.66 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  34.36 
 
 
182 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3999  protein of unknown function DUF1470  33.33 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24720  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  33.33 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2411  hypothetical protein  30.27 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4814  protein of unknown function DUF1470  36.36 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1791  hypothetical protein  34.81 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1443  hypothetical protein  35.8 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197682  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2347  protein of unknown function DUF1470  32.35 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4963  hypothetical protein  37.86 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241292  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3877  protein of unknown function DUF1470  36.59 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000164809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1148  hypothetical protein  36.43 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1119  hypothetical protein  36.43 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0577  hypothetical protein  35.71 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1136  hypothetical protein  36.43 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3432  protein of unknown function DUF1470  39.5 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4790  protein of unknown function DUF1470  36.73 
 
 
172 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0437563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4227  hypothetical protein  35.97 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4338  hypothetical protein  34.91 
 
 
182 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.938729  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2288  protein of unknown function DUF1470  33.06 
 
 
164 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.741376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4664  hypothetical protein  30.83 
 
 
181 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0323  protein of unknown function DUF1470  30.71 
 
 
187 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  31.47 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  29.45 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1541  hypothetical protein  29.74 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0656289  normal  0.28934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5018  hypothetical protein  31.21 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1905  protein of unknown function DUF1470  33.59 
 
 
172 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2145  protein of unknown function DUF1470  39.19 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0559  protein of unknown function DUF1470  31.34 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5129  hypothetical protein  31.67 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116478  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1862  hypothetical protein  26.67 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2131  hypothetical protein  26.54 
 
 
181 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  24.46 
 
 
192 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0120  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
342 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3390  hypothetical protein  25.45 
 
 
180 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388743  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1921  protein of unknown function DUF1470  28.81 
 
 
186 aa  41.6  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000367455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1073  hypothetical protein  40.54 
 
 
233 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00265826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>