40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3620 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  38.51 
 
 		 163 aa  93.6  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.04 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.04 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.68 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.32 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  33.33 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.38 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.1 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  27.45 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.95 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.92 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.39 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  31.54 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.7 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.16 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.03 
 
 		 389 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  27.35 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  25.78 
 
 		 338 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  28.72 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.96 
 
 		 377 aa  44.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.73 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  31.37 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.67 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  31.68 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.21 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  30.93 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  34.94 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  28.95 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  30.11 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>