109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3200 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 121 aa  239  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.47 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  55.21 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  48.08 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  50.54 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  51.11 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  46.15 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  43.14 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  43.96 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 106 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  43.88 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  46.43 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  45.1 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  45.28 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  46.88 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  38.55 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  35.11 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3521  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3520  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.360889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3305  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 114 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3220  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 131 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3565  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3527  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 140 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  39.19 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>