279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0482 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 458 aa  887    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.74 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 441 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 451 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 417 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.27 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  24.25 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.2 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.2 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  29.55 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  29.63 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  29.42 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.58 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  29.92 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.61 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.61 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  29.1 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  29.1 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  29.1 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  20.29 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  26 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  21.01 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  20.94 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.4 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  25 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.71 
 
 		 1829 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  20.29 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  23.65 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  36.47 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 499 aa  60.1  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  26.12 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  22.6 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  24.7 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  20.92 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>