More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2563 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.83 
 
 		 1027 aa  680    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1019 aa  2050    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  52.5 
 
 		 1025 aa  1086    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.73 
 
 		 1010 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  37.01 
 
 		 1022 aa  666    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  40.24 
 
 		 1019 aa  758    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  34.97 
 
 		 1036 aa  619  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  35.01 
 
 		 1036 aa  619  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  35.26 
 
 		 1012 aa  615  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.16 
 
 		 1032 aa  609  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  35.06 
 
 		 1025 aa  602  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1013 aa  599  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1009 aa  601  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 		 1071 aa  589  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  32.5 
 
 		 1039 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  34.26 
 
 		 1042 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  33.88 
 
 		 1029 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 		 1051 aa  592  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  33.88 
 
 		 1045 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  34.26 
 
 		 1050 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1047 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  33.88 
 
 		 1036 aa  588  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1039 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  34.26 
 
 		 1049 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  33.3 
 
 		 1041 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1048 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  34.26 
 
 		 1049 aa  580  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  34.18 
 
 		 1067 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  34.08 
 
 		 1021 aa  582  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1039 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1067 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1040 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  34.02 
 
 		 1025 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1089 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  33.8 
 
 		 1071 aa  577  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  34.07 
 
 		 1048 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1024 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  34.07 
 
 		 1049 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  32.67 
 
 		 1073 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  33.84 
 
 		 1047 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  34.07 
 
 		 1049 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1027 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1047 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1036 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  32.97 
 
 		 1024 aa  566  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1053 aa  567  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1022 aa  569  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1057 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  32.72 
 
 		 1028 aa  568  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1021 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1021 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1047 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1019 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1023 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1053 aa  565  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1031 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1021 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  33.07 
 
 		 1024 aa  566  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 		 1056 aa  559  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  32.56 
 
 		 1019 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1024 aa  562  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1021 aa  561  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  32.06 
 
 		 1031 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  33.04 
 
 		 1025 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.05 
 
 		 1057 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1029 aa  558  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1060 aa  559  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1021 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.73 
 
 		 1056 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  31.38 
 
 		 1022 aa  554  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.73 
 
 		 1056 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.47 
 
 		 1056 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 		 1019 aa  556  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  32.85 
 
 		 1025 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1017 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1029 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.63 
 
 		 1056 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1028 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1017 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1029 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 		 1040 aa  550  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1029 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1013 aa  551  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 		 1050 aa  551  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  32.03 
 
 		 1021 aa  551  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1023 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1018 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 		 1014 aa  549  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 		 1059 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1018 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  32.1 
 
 		 1016 aa  548  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1029 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1054 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1016 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 		 1024 aa  544  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1051 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04840  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1018 aa  545  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 		 1029 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1021 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1023 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>