77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00720 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  100 
 
 
452 aa  919    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  50.4 
 
 
441 aa  354  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  46.6 
 
 
480 aa  307  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  41.44 
 
 
367 aa  269  7e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  39.63 
 
 
356 aa  244  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  39.94 
 
 
363 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  39.26 
 
 
389 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  38.86 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  37.4 
 
 
422 aa  219  7e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  38.51 
 
 
344 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.94 
 
 
362 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  37.46 
 
 
367 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  39.83 
 
 
370 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  36.93 
 
 
367 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  38.37 
 
 
362 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  37.71 
 
 
362 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  37.13 
 
 
361 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  35.89 
 
 
365 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  37.64 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  35.63 
 
 
364 aa  199  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  36.67 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  34.87 
 
 
347 aa  197  3e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  36.31 
 
 
367 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 
381 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  35.52 
 
 
343 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  36.06 
 
 
350 aa  192  9e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 
341 aa  190  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  35.24 
 
 
357 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  37.08 
 
 
359 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  36.16 
 
 
391 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.82 
 
 
325 aa  186  9e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  32.01 
 
 
341 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.13 
 
 
344 aa  183  6e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  34.66 
 
 
359 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  37.61 
 
 
367 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  36.39 
 
 
382 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  36.39 
 
 
358 aa  177  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  33.79 
 
 
391 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  34.82 
 
 
355 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.28 
 
 
383 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  34.06 
 
 
391 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  35.33 
 
 
391 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  36.39 
 
 
380 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  35.66 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  37.18 
 
 
382 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  36.78 
 
 
382 aa  162  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  37.98 
 
 
379 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  34.1 
 
 
360 aa  155  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  32.97 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  31.85 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  30.19 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  32.13 
 
 
349 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  30.51 
 
 
358 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  27.67 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  22.8 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  26.82 
 
 
335 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  22.8 
 
 
369 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  22.8 
 
 
369 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  25.71 
 
 
325 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  22.8 
 
 
369 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  22.8 
 
 
369 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  22.8 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  26.39 
 
 
335 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  22.53 
 
 
369 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  22.32 
 
 
339 aa  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  21.96 
 
 
339 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  25.15 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  24.11 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  22.48 
 
 
369 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  22.25 
 
 
370 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  22.25 
 
 
370 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  25.67 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  28.06 
 
 
323 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  21.98 
 
 
370 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  22.62 
 
 
370 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  24.85 
 
 
363 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  21.95 
 
 
370 aa  43.1  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>