More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03010 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB03010  mitochondrial ribosomal protein L23, putative  100 
 
 
163 aa  335  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0650415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  48.44 
 
 
143 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  51.28 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  46.92 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  48.74 
 
 
142 aa  127  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  49.58 
 
 
142 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  49.57 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  47.9 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  50.85 
 
 
143 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  44.92 
 
 
142 aa  122  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  46.22 
 
 
142 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  47.46 
 
 
142 aa  120  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09469  50S ribosomal protein L13 (AFU_orthologue; AFUA_2G10510)  40.36 
 
 
166 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  47.01 
 
 
142 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  45.31 
 
 
143 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  45.31 
 
 
143 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  47.9 
 
 
142 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  48.31 
 
 
142 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  45.6 
 
 
146 aa  117  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  44.09 
 
 
144 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  48.74 
 
 
142 aa  117  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  47.06 
 
 
142 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  47.06 
 
 
142 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  47.06 
 
 
142 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 
142 aa  117  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  117  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 
142 aa  117  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  47.86 
 
 
142 aa  117  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  51.24 
 
 
149 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  47.06 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  46.61 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  46.22 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  51.24 
 
 
149 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  46.15 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  48.31 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  50.42 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  44.53 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  45.67 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  48.72 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  46.15 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0031  50S ribosomal protein L13  45.3 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  51.33 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  44 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  45.67 
 
 
144 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  47.83 
 
 
149 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  47.46 
 
 
143 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  47.01 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  44.07 
 
 
142 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  45.76 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3518  50S ribosomal protein L13  47.83 
 
 
149 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3454  50S ribosomal protein L13  47.83 
 
 
149 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3372  50S ribosomal protein L13  47.83 
 
 
149 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165547  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  45.3 
 
 
143 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37954  predicted protein  46.56 
 
 
174 aa  114  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0776157  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  47.46 
 
 
151 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  44.54 
 
 
170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0628  50S ribosomal protein L13  48.7 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0115715  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
143 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  46.61 
 
 
142 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  44.44 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  44.92 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  47.9 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  47.01 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2727  ribosomal protein L13  44 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000734549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  44.19 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  45.76 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  43.86 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  45.3 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  44.74 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  44.74 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3437  50S ribosomal protein L13  46.09 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170329  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  41.03 
 
 
151 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  46.15 
 
 
142 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  46.15 
 
 
142 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  46.15 
 
 
142 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  48.72 
 
 
143 aa  112  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  46.15 
 
 
142 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  46.09 
 
 
144 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  44.92 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  47.06 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  47.01 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  44.92 
 
 
144 aa  111  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  40.46 
 
 
147 aa  111  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  45.3 
 
 
142 aa  111  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1547  ribosomal protein L13  44.74 
 
 
144 aa  110  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00044315  hitchhiker  0.00000000000000212173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  44.62 
 
 
147 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  43.59 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  46.15 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  45.38 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>