More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3437 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3437  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
149 aa  308  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170329  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3518  50S ribosomal protein L13  83.22 
 
 
149 aa  265  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3372  50S ribosomal protein L13  83.22 
 
 
149 aa  265  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3454  50S ribosomal protein L13  83.22 
 
 
149 aa  265  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  54.93 
 
 
147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 
142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 
143 aa  163  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  55.24 
 
 
142 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 
143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  58.91 
 
 
149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  57.69 
 
 
142 aa  160  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  57.69 
 
 
142 aa  160  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 
143 aa  159  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  52.94 
 
 
146 aa  159  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  56.92 
 
 
170 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  54.41 
 
 
142 aa  158  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  57.03 
 
 
143 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  52.45 
 
 
149 aa  157  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
151 aa  156  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  52.27 
 
 
144 aa  156  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 
142 aa  156  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 
163 aa  155  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  54.81 
 
 
142 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
150 aa  156  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
150 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  53.08 
 
 
142 aa  155  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
150 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  53.03 
 
 
147 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 
142 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  51.54 
 
 
145 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 
142 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  57.03 
 
 
143 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
150 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  53.28 
 
 
142 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  52.21 
 
 
146 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 
142 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 
142 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 
142 aa  154  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 
142 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  50.76 
 
 
158 aa  154  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 
142 aa  154  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  50.77 
 
 
145 aa  154  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  52.31 
 
 
144 aa  154  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  50.77 
 
 
145 aa  154  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  52.17 
 
 
144 aa  154  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  52.38 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  54.81 
 
 
142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  54.62 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
142 aa  153  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  55.47 
 
 
142 aa  153  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  51.15 
 
 
148 aa  153  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  57.81 
 
 
151 aa  153  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 
142 aa  153  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  52.27 
 
 
148 aa  153  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  51.52 
 
 
147 aa  153  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  51.39 
 
 
145 aa  153  9e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  50.77 
 
 
145 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  57.6 
 
 
148 aa  152  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
149 aa  152  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  50.39 
 
 
142 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  57.81 
 
 
151 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  53.28 
 
 
142 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  52.31 
 
 
145 aa  152  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
149 aa  152  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  52.27 
 
 
147 aa  153  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  56.35 
 
 
146 aa  152  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 
149 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  53.08 
 
 
142 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  53.08 
 
 
142 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  55.91 
 
 
142 aa  151  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  53.08 
 
 
144 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  52.34 
 
 
151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  52.34 
 
 
151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 
148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  50.76 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 
142 aa  150  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  55.47 
 
 
143 aa  150  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
144 aa  150  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 
159 aa  150  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 
142 aa  150  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  47.92 
 
 
150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  51.39 
 
 
154 aa  150  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  150  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  48.59 
 
 
149 aa  150  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  53.08 
 
 
142 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 
149 aa  150  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
147 aa  150  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  55.04 
 
 
142 aa  150  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  53.08 
 
 
142 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2985  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 
151 aa  150  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  55.04 
 
 
142 aa  150  8e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  48.85 
 
 
148 aa  149  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  48.91 
 
 
151 aa  149  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  50.77 
 
 
142 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  53.08 
 
 
142 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>