More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3518 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3372  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
149 aa  310  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3454  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
149 aa  310  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3518  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
149 aa  310  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3437  50S ribosomal protein L13  83.22 
 
 
149 aa  265  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170329  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
142 aa  167  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  166  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  166  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 
143 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  62.02 
 
 
149 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  56.82 
 
 
144 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  54.55 
 
 
142 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  54.73 
 
 
149 aa  164  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 
149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  53.28 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 
143 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
142 aa  161  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  59.23 
 
 
142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  52.27 
 
 
158 aa  160  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  53.79 
 
 
147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  57.69 
 
 
151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 
147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
144 aa  160  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  54.17 
 
 
145 aa  160  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  53.03 
 
 
145 aa  160  6e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
142 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  54.62 
 
 
148 aa  160  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  160  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  160  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
142 aa  159  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  53.44 
 
 
148 aa  159  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
142 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
142 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
142 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
144 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  57.69 
 
 
149 aa  159  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
142 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  57.69 
 
 
149 aa  159  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
142 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 
147 aa  158  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  56.92 
 
 
142 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  52.31 
 
 
161 aa  158  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  54.23 
 
 
147 aa  158  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 
144 aa  158  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
170 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  51.59 
 
 
143 aa  157  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  56.15 
 
 
142 aa  157  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  57.69 
 
 
151 aa  158  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  51.54 
 
 
142 aa  157  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  52.27 
 
 
147 aa  158  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  52.08 
 
 
154 aa  157  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
142 aa  157  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  157  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
150 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  57.36 
 
 
143 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  55.38 
 
 
147 aa  157  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  57.81 
 
 
151 aa  157  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  51.91 
 
 
148 aa  156  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 
142 aa  156  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
142 aa  156  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  156  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  54.62 
 
 
151 aa  156  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  52.31 
 
 
145 aa  156  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  155  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  155  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  155  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  155  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  155  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  155  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  156  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  155  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  52.38 
 
 
146 aa  155  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  50.77 
 
 
142 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  53.17 
 
 
146 aa  155  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 
145 aa  155  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  54.69 
 
 
151 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  55.38 
 
 
150 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 
151 aa  155  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  54.11 
 
 
143 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  54.69 
 
 
151 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  53.91 
 
 
142 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  52.27 
 
 
147 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  53.91 
 
 
142 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  51.54 
 
 
176 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
143 aa  154  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
142 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
142 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  51.54 
 
 
142 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2519  50S ribosomal protein L13  51.54 
 
 
142 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
142 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
142 aa  154  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  51.54 
 
 
142 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
142 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 
142 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  51.54 
 
 
142 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  53.03 
 
 
147 aa  154  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>