More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0628 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0628  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0115715  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  70.95 
 
 		 147 aa  220  6e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  69.39 
 
 		 148 aa  212  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  68.03 
 
 		 148 aa  209  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  66.89 
 
 		 148 aa  207  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  64.19 
 
 		 147 aa  205  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  63.51 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  54.86 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  57.24 
 
 		 145 aa  173  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 145 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  59.03 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  55.17 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 149 aa  166  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 148 aa  166  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 147 aa  164  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 143 aa  163  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  54.42 
 
 		 151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  53.19 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 147 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf386  50S ribosomal protein L13  53.79 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.112252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  57.45 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2341  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 176 aa  157  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>