174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA02760 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA02760  oligoribonuclease, putative  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  50.7 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.25 
 
 
222 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.03 
 
 
235 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.89 
 
 
212 aa  142  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57408  predicted protein  48.65 
 
 
211 aa  142  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.241449  normal  0.12604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.7 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.07 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.37 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  45.33 
 
 
222 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.48 
 
 
216 aa  137  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10348  RNA exonuclease Rex2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11820)  44.59 
 
 
194 aa  136  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.111499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4379  oligoribonuclease  44.52 
 
 
181 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.39 
 
 
191 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  41.82 
 
 
220 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  44.37 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.83 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  44.37 
 
 
208 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  42.68 
 
 
269 aa  132  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  45.77 
 
 
215 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  45.77 
 
 
215 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.9 
 
 
198 aa  131  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  45.77 
 
 
215 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  43.15 
 
 
216 aa  131  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  45.83 
 
 
250 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  45.77 
 
 
200 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  40 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.37 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  43.62 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  42.96 
 
 
214 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  43.66 
 
 
214 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  42.96 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  39.87 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  43.06 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  41.5 
 
 
181 aa  128  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  41.38 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  46.58 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  42.25 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  39.49 
 
 
208 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  40.82 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.07 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.56 
 
 
188 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1100  oligoribonuclease  38.71 
 
 
184 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0275698  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  44.37 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  42.96 
 
 
195 aa  124  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  42.25 
 
 
215 aa  124  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.5 
 
 
194 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  41.55 
 
 
193 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  40.69 
 
 
205 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  39.86 
 
 
211 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.96 
 
 
183 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  42.25 
 
 
198 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  39.31 
 
 
184 aa  121  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  41.38 
 
 
181 aa  121  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  38.1 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  42.25 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  42.96 
 
 
634 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  40.14 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  41.72 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0884  oligoribonuclease  40.69 
 
 
215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  39.74 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2911  oligoribonuclease  39.61 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  40.4 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  40 
 
 
210 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0813  oligoribonuclease  40.69 
 
 
219 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526826  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  39.31 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00920  oligoribonuclease  41.22 
 
 
194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0529998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3481  oligoribonuclease  40.41 
 
 
181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2783  oligoribonuclease  38.36 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  41.33 
 
 
207 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  39.6 
 
 
187 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  42.96 
 
 
180 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0539  oligoribonuclease  40 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  40.52 
 
 
206 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1470  oligoribonuclease  39.35 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3287  oligoribonuclease  42.25 
 
 
181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.161862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0591  oligoribonuclease  37.66 
 
 
193 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  38.1 
 
 
183 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  41.78 
 
 
181 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2797  oligoribonuclease  37.16 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2666  oligoribonuclease  37.16 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0341  oligoribonuclease  36.3 
 
 
183 aa  114  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0985  oligoribonuclease  38.31 
 
 
187 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3547  oligoribonuclease  39.58 
 
 
181 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0546  oligoribonuclease  37.66 
 
 
193 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3808  oligoribonuclease  35.44 
 
 
181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3661  oligoribonuclease  35.44 
 
 
181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0708  oligoribonuclease  35.44 
 
 
181 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.367398  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  39.73 
 
 
178 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0591  oligoribonuclease  37.97 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  hitchhiker  0.000123281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3439  oligoribonuclease  37.97 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0790  oligoribonuclease  41.1 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  39.73 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  40.27 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1270  oligoribonuclease  39.35 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1502  oligoribonuclease  39.46 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.678384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1893  oligoribonuclease  36.67 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.53221  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4178  oligoribonuclease  41.78 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3931  oligoribonuclease  36.25 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2225  oligoribonuclease  40.91 
 
 
211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>