137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2122 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  100 
 
 		 298 aa  619  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  51.01 
 
 		 296 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  41.61 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  41.22 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  37.5 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.4 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.15 
 
 		 552 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.71 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  29.24 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  28.24 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  28.24 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 606 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.37 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 610 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 610 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.53 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 629 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 619 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.25 
 
 		 594 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 		 623 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  31.85 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 		 619 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 567 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 619 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 567 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  27.84 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  25.59 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 		 572 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  27.45 
 
 		 326 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.49 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  28.1 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.47 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.92 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 		 606 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 585 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  24.76 
 
 		 567 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  27.12 
 
 		 326 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  28.15 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  28.48 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  28.48 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  28.09 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  30.13 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  27.54 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  24.07 
 
 		 558 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 		 571 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  27.9 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.05 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.01 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  26.95 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.91 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  24.18 
 
 		 563 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  24.07 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  30.21 
 
 		 568 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  23.86 
 
 		 573 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.33 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  23.86 
 
 		 573 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  24.64 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  23.93 
 
 		 575 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  27.27 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  27.36 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.21 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 572 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 		 568 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  25.28 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 		 568 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 		 575 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.75 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 		 593 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  27.9 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  23.92 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.47 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 		 563 aa  86.3  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  24.56 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.82 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.41 
 
 		 535 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.43 
 
 		 536 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.77 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.05 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.33 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.78 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.39 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.75 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.04 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  23 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.88 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.38 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.25 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.94 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.87 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.98 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  21 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.35 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.89 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2522  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.29 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.05 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  24.04 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.6 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  23 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>