More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1252 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  100 
 
 		 776 aa  1617    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  42.88 
 
 		 907 aa  552  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  37.78 
 
 		 786 aa  487  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  38.88 
 
 		 740 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 768 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  37.32 
 
 		 794 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  37.78 
 
 		 772 aa  472  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  37.1 
 
 		 786 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  37.55 
 
 		 762 aa  466  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  38.59 
 
 		 759 aa  465  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  37.48 
 
 		 743 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  36.98 
 
 		 785 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  35.77 
 
 		 773 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  38.01 
 
 		 765 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  36.36 
 
 		 767 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  35.58 
 
 		 850 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  36.78 
 
 		 815 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  36.93 
 
 		 854 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  36.21 
 
 		 755 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  36.31 
 
 		 760 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  36.81 
 
 		 730 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  33.97 
 
 		 783 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  36.38 
 
 		 762 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  36.02 
 
 		 750 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  35.25 
 
 		 774 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  35.7 
 
 		 752 aa  388  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 		 857 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  34.27 
 
 		 787 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 		 870 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.36 
 
 		 858 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 		 862 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 		 841 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 		 857 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  33.04 
 
 		 850 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  33.38 
 
 		 742 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  34.26 
 
 		 838 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 		 857 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 		 834 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 		 888 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 		 821 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  33.93 
 
 		 826 aa  363  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  33.48 
 
 		 743 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  33.38 
 
 		 743 aa  360  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  33.38 
 
 		 743 aa  360  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 810 aa  359  9e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 846 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.69 
 
 		 846 aa  357  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  33.91 
 
 		 844 aa  356  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  33.91 
 
 		 839 aa  356  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  33.91 
 
 		 928 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  33.43 
 
 		 846 aa  355  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  33.91 
 
 		 839 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  33.91 
 
 		 844 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  33.91 
 
 		 844 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  33.91 
 
 		 844 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  32.52 
 
 		 732 aa  353  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  33.59 
 
 		 787 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 801 aa  349  9e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 728 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  31.31 
 
 		 698 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 678 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  28.76 
 
 		 818 aa  300  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  29.36 
 
 		 841 aa  296  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  28.62 
 
 		 827 aa  294  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.45 
 
 		 795 aa  293  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  31.61 
 
 		 773 aa  292  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  28.66 
 
 		 829 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  28.48 
 
 		 796 aa  286  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  27.56 
 
 		 748 aa  280  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  29.55 
 
 		 802 aa  279  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  28.53 
 
 		 773 aa  277  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0444  penicillin-binding protein, 1A family  29.83 
 
 		 848 aa  273  9e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0671851  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  29.78 
 
 		 812 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  31 
 
 		 796 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  28.09 
 
 		 818 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  31.7 
 
 		 890 aa  267  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  26.91 
 
 		 823 aa  267  5.999999999999999e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  28.49 
 
 		 804 aa  265  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  30.54 
 
 		 713 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  30.54 
 
 		 713 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  30.54 
 
 		 713 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  30.54 
 
 		 713 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  29.16 
 
 		 797 aa  262  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  30.54 
 
 		 713 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  27.59 
 
 		 807 aa  262  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  30.54 
 
 		 713 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  27.96 
 
 		 830 aa  261  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  28.08 
 
 		 814 aa  261  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  27.71 
 
 		 790 aa  256  8e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  29.8 
 
 		 777 aa  256  9e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  27.96 
 
 		 843 aa  256  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  28.36 
 
 		 794 aa  256  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  27.12 
 
 		 831 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  28.36 
 
 		 794 aa  256  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  27.92 
 
 		 791 aa  256  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  25.89 
 
 		 823 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 807 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0466  penicillin-binding protein  27.6 
 
 		 863 aa  253  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  27.63 
 
 		 838 aa  253  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  27.43 
 
 		 803 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>