More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0279 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  100 
 
 		 306 aa  628  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  73.36 
 
 		 305 aa  475  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  69.08 
 
 		 306 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  69.74 
 
 		 307 aa  451  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  70.26 
 
 		 306 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  65.47 
 
 		 308 aa  424  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  64.8 
 
 		 307 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  55.92 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  57.19 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  55.78 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  55.45 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  57.1 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  56.15 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  56.44 
 
 		 303 aa  361  7.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  54.28 
 
 		 303 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  51.32 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  52.81 
 
 		 305 aa  326  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  52.15 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  52.48 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  51.49 
 
 		 304 aa  322  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  51.16 
 
 		 313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  50.99 
 
 		 305 aa  315  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  49.17 
 
 		 314 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  49.17 
 
 		 314 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  48.18 
 
 		 314 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  47.85 
 
 		 313 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  48.84 
 
 		 305 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  48.87 
 
 		 308 aa  291  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  47.02 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  45.07 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  41.97 
 
 		 304 aa  265  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  42 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  36.88 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.51 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.91 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.91 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.34 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.51 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  23.59 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  25.57 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  26.37 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  22.87 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  24.46 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  22.91 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  31.88 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  23.46 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  31.88 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  22.67 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  25.39 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  38.21 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.54 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  29.71 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  25.74 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  36.13 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  28.33 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.01 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  28.03 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  22.37 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  25.48 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  23.25 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  33.61 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  23.74 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  23.74 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  23.74 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16505  Rfae domain I  26.32 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119245  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  25.8 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  30.83 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  31.21 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  23.18 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  34.75 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  30.94 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  23.32 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  24.36 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  23.1 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  31.09 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  32.23 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  25.97 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  24.54 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  29.37 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  24.46 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  30.95 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  30.95 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  31.62 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  25.98 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  24.83 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  25.14 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25.55 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  28.57 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  36 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  34.43 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  31.62 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  23.68 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  28.64 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>