216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1944 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1944  RarD protein  100 
 
 		 294 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000444417  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0151  RarD protein  67.47 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3162  transporter DMT superfamily protein  35.71 
 
 		 294 aa  198  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2916  RarD protein  36.3 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2437  transporter DMT superfamily protein  33.9 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3436  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.56 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.509712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3361  RarD protein  35.74 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0796601  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2327  transporter DMT superfamily protein  33.22 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3591  rarD protein  35.64 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2500  transporter DMT superfamily protein  32.16 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0947  transporter DMT superfamily protein  35.64 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0982  transporter DMT superfamily protein  35.64 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1849  transporter DMT superfamily protein  29.29 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2500  transporter DMT superfamily protein  31.53 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  0.016455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1360  RarD protein, DMT superfamily transporter  31.53 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0549521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1302  transporter DMT superfamily protein  29.76 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7043  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.93 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497948  normal  0.0116084 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0357  rarD protein  29.25 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0687634 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1723  rarD protein  30.66 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.404594  normal  0.849801 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0025  RarD protein  28.97 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5313  rarD protein  29.8 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5547  transporter DMT superfamily protein  29.8 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0111  RarD protein  29.39 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4122  transporter DMT superfamily protein  30.68 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4725  transporter DMT superfamily protein  29.39 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5418  transporter DMT superfamily protein  30.2 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3259  transporter DMT superfamily protein  30.2 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0786612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4871  transporter DMT superfamily protein  29.8 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1653  hypothetical protein  27.68 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19160  hypothetical protein  27.15 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.552283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2440  rarD protein  29.43 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2239  rarD protein  31.15 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1956  rarD protein  31.43 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.435358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1260  rarD protein  31.43 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2234  RarD protein  31.43 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0973  rarD protein  31.02 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1278  rarD protein  31.43 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2921  RarD protein  31.43 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.037743  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3046  RarD protein  31.84 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  22.3 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  23.31 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  24.41 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  23.48 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  22.18 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  21.25 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  24.92 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  24.91 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.56 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  22.43 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  24.53 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  24.33 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1118  rarD protein  27.51 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  24.75 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  23 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.33 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  22.18 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  27.85 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  23.91 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  23.91 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  24.83 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  23.91 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  23.91 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  23.91 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  23.81 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  25.58 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  25.09 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  23.91 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  22.18 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  23.68 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  21.51 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  23.53 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  24.57 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0152  RarD protein  28.47 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.886029  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  24.82 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  24.5 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  24.57 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  23.05 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.11 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  23.53 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  25.49 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  25.26 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  21.3 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  21.3 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  21.3 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  24.47 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0508  permease  26.21 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.057497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  21.3 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  21.3 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1654  RarD protein, DMT superfamily transporter  23.89 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  21.09 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  22.45 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  22.45 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  22.26 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  24.11 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  23.33 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  23.49 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  22.45 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  20.94 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  21.3 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  23.31 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>