233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1360 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1360  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 300 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0549521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2500  transporter DMT superfamily protein  99 
 
 		 300 aa  557  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  0.016455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2327  transporter DMT superfamily protein  57.29 
 
 		 295 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2437  transporter DMT superfamily protein  57.63 
 
 		 295 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3436  RarD protein, DMT superfamily transporter  56.95 
 
 		 295 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.509712 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3162  transporter DMT superfamily protein  55.71 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2500  transporter DMT superfamily protein  57.69 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3361  RarD protein  55.41 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0796601  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3591  rarD protein  57.14 
 
 		 307 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2916  RarD protein  52.56 
 
 		 293 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5313  rarD protein  51.9 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5547  transporter DMT superfamily protein  51.9 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0025  RarD protein  52.25 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7043  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.48 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497948  normal  0.0116084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4725  transporter DMT superfamily protein  50.87 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0111  RarD protein  52.25 
 
 		 299 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4122  transporter DMT superfamily protein  50.7 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1302  transporter DMT superfamily protein  50 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4871  transporter DMT superfamily protein  52.94 
 
 		 299 aa  214  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5418  transporter DMT superfamily protein  52.6 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0982  transporter DMT superfamily protein  40.07 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0947  transporter DMT superfamily protein  40.07 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3259  transporter DMT superfamily protein  51.56 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0786612 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1956  rarD protein  52.25 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.435358  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2239  rarD protein  48.96 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1260  rarD protein  52.25 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2234  RarD protein  52.25 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1278  rarD protein  52.25 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2921  RarD protein  52.25 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.037743  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0973  rarD protein  51.9 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3046  RarD protein  52.25 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19160  hypothetical protein  45.17 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.552283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1653  hypothetical protein  45.9 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0357  rarD protein  36.39 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0687634 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1849  transporter DMT superfamily protein  35.03 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0151  RarD protein  29.51 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1944  RarD protein  31.53 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1723  rarD protein  36.97 
 
 		 356 aa  158  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.404594  normal  0.849801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2440  rarD protein  33.57 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  30.38 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  31.33 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  31.33 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  31.33 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  29.57 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.79 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  28.57 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  28.38 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  30.8 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  28.19 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  33.78 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.21 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  28.21 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  28.21 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  32 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  27.8 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  31.34 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  31.34 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  27.5 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  28.21 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  31.34 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  27.5 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  27.84 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  30.99 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  27.14 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  29.37 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  29.12 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.12 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  29.12 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  29.12 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  29.12 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  27.99 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  29.12 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  29.12 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  29.12 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  26.71 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  31.54 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  27.21 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  30.07 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.07 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  30.51 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  24.75 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  26.55 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  27.68 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.25 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  27.46 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  28.87 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  29.62 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  25.37 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  25.37 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  30.27 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.43 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  29.73 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  35.11 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  28.12 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  30.3 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  30 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  25.37 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  21.89 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  27.99 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  29.25 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>