232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19160 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_19160  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.552283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1653  hypothetical protein  96.66 
 
 		 311 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1302  transporter DMT superfamily protein  65.65 
 
 		 297 aa  350  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7043  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.13 
 
 		 298 aa  254  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497948  normal  0.0116084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4725  transporter DMT superfamily protein  49.66 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5313  rarD protein  50 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5547  transporter DMT superfamily protein  50 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0111  RarD protein  49.32 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3259  transporter DMT superfamily protein  50.51 
 
 		 299 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0786612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4122  transporter DMT superfamily protein  49.48 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0025  RarD protein  50.52 
 
 		 298 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5418  transporter DMT superfamily protein  50.68 
 
 		 299 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4871  transporter DMT superfamily protein  50.68 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1956  rarD protein  53.61 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.435358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1260  rarD protein  53.61 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2234  RarD protein  53.61 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1278  rarD protein  53.61 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2921  RarD protein  53.61 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.037743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2239  rarD protein  51.72 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0973  rarD protein  53.26 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3046  RarD protein  53.61 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3436  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.54 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.509712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3361  RarD protein  44.56 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0796601  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3162  transporter DMT superfamily protein  43.3 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2327  transporter DMT superfamily protein  43.54 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2437  transporter DMT superfamily protein  44.56 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3591  rarD protein  44.56 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2916  RarD protein  42.37 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2500  transporter DMT superfamily protein  43.71 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2440  rarD protein  38.81 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2500  transporter DMT superfamily protein  45.52 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  0.016455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1360  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.52 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0549521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0947  transporter DMT superfamily protein  35.25 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0982  transporter DMT superfamily protein  35.25 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  33.89 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  33.79 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  33.79 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  33.79 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1849  transporter DMT superfamily protein  32.78 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1723  rarD protein  36.03 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.404594  normal  0.849801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  34.78 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.42 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0357  rarD protein  33.22 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0687634 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.58 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  32.3 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  31.76 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.11 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  32.42 
 
 		 335 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  31.86 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  31.86 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  31.86 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  31.97 
 
 		 298 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  30.64 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.64 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  30.64 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  30.64 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  30.64 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  30.64 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  31.63 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  30.74 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  34.48 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  30.41 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  30.85 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  33.11 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  33.79 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  33.33 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  33.56 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  31.93 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  31.97 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  33.33 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  32.88 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  28.77 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  33.11 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  28.77 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  34.12 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  31.06 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  33 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  32.08 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  31.62 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  33.11 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.56 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  32.54 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.11 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  33.56 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  33.56 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  33.33 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  29.51 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  33.33 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.76 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  33.33 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  27.05 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  34.13 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  34.34 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  32.09 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.58 
 
 		 309 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  31.86 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  31.42 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  31.76 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3677  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.65 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0151  RarD protein  27.3 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>