237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5547 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5313  rarD protein  100 
 
 		 299 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5547  transporter DMT superfamily protein  100 
 
 		 299 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4725  transporter DMT superfamily protein  98.66 
 
 		 299 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0111  RarD protein  93.31 
 
 		 299 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5418  transporter DMT superfamily protein  94.63 
 
 		 299 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4871  transporter DMT superfamily protein  93.96 
 
 		 299 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3259  transporter DMT superfamily protein  90.27 
 
 		 299 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0786612 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7043  RarD protein, DMT superfamily transporter  70.1 
 
 		 298 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497948  normal  0.0116084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4122  transporter DMT superfamily protein  69.39 
 
 		 296 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1278  rarD protein  77.44 
 
 		 297 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2921  RarD protein  77.44 
 
 		 297 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.037743  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1956  rarD protein  77.1 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.435358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1260  rarD protein  77.1 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2234  RarD protein  77.1 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0025  RarD protein  69.57 
 
 		 298 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0973  rarD protein  76.77 
 
 		 297 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3046  RarD protein  77.1 
 
 		 297 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2239  rarD protein  77.05 
 
 		 297 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1302  transporter DMT superfamily protein  53.45 
 
 		 297 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1653  hypothetical protein  50.17 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3436  RarD protein, DMT superfamily transporter  50.34 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.509712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2327  transporter DMT superfamily protein  50.34 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19160  hypothetical protein  49.49 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.552283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2500  transporter DMT superfamily protein  50.88 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3361  RarD protein  49.08 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0796601  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2437  transporter DMT superfamily protein  49.66 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3162  transporter DMT superfamily protein  47.77 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2916  RarD protein  47.06 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2500  transporter DMT superfamily protein  51.56 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  0.016455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1360  RarD protein, DMT superfamily transporter  51.9 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0549521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3591  rarD protein  46.18 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0982  transporter DMT superfamily protein  38.95 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0947  transporter DMT superfamily protein  38.95 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0357  rarD protein  35.86 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0687634 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1723  rarD protein  36.1 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.404594  normal  0.849801 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1849  transporter DMT superfamily protein  35.13 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2440  rarD protein  35.11 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  34.87 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  35.22 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  33.11 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0151  RarD protein  30.27 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  31.85 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1944  RarD protein  29.89 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000444417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  28.19 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  30.03 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  28.28 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  31.51 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  27.3 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  27.21 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  27.24 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  32.64 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  31.4 
 
 		 295 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  26.87 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.87 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.43 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  26.87 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  26.87 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  26.87 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  26.87 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  26.87 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  26.87 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  28.18 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  29.17 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  31.65 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.43 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  28.72 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  29.15 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  32.63 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  29.73 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  28.28 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  28.93 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2968  RarD protein  30.48 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  26.28 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  25 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.14 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.73 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4698  RarD protein  33.69 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000777154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  29.15 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  26.53 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  30.85 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  28.37 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.29 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  26.53 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  26.53 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  27.12 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  27.86 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  28.21 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  27.12 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  25.68 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  26.53 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  27.12 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  29.29 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  28.52 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  27.89 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  29.29 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  29.29 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  31.76 
 
 		 295 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  30.36 
 
 		 310 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  25.25 
 
 		 313 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.7 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>