217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1723 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1723  rarD protein  100 
 
 		 356 aa  716    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.404594  normal  0.849801 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1849  transporter DMT superfamily protein  39.66 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0357  rarD protein  39.46 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0687634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7043  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.31 
 
 		 298 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497948  normal  0.0116084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4122  transporter DMT superfamily protein  38.4 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4725  transporter DMT superfamily protein  36.27 
 
 		 299 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3162  transporter DMT superfamily protein  36.86 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0111  RarD protein  36.49 
 
 		 299 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2916  RarD protein  36.64 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5313  rarD protein  36.27 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5547  transporter DMT superfamily protein  36.27 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0025  RarD protein  38.4 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3436  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.41 
 
 		 295 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.509712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2327  transporter DMT superfamily protein  40.41 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2437  transporter DMT superfamily protein  40.24 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3259  transporter DMT superfamily protein  35.14 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0786612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2500  transporter DMT superfamily protein  39.92 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3361  RarD protein  37.07 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0796601  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1302  transporter DMT superfamily protein  34.25 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2440  rarD protein  33.11 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0982  transporter DMT superfamily protein  34.98 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4871  transporter DMT superfamily protein  35.93 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0947  transporter DMT superfamily protein  34.98 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1360  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.02 
 
 		 300 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0549521  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5418  transporter DMT superfamily protein  35.59 
 
 		 299 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3591  rarD protein  37.41 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2500  transporter DMT superfamily protein  38.21 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  0.016455 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1944  RarD protein  30.87 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000444417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1653  hypothetical protein  36.76 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2239  rarD protein  36.08 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1956  rarD protein  37.07 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.435358  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1278  rarD protein  37.07 
 
 		 297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1260  rarD protein  37.07 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2921  RarD protein  37.07 
 
 		 297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.037743  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2234  RarD protein  37.07 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0973  rarD protein  37.07 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19160  hypothetical protein  35.14 
 
 		 299 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.552283 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3046  RarD protein  36.73 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0151  RarD protein  25.69 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  28.08 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  28.33 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  28.33 
 
 		 296 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.33 
 
 		 296 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  28.33 
 
 		 296 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  28.15 
 
 		 295 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  28.33 
 
 		 296 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  28.33 
 
 		 296 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  28.33 
 
 		 296 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  28.08 
 
 		 295 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  28.08 
 
 		 295 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  28.08 
 
 		 295 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  28.87 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  27.74 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  26.71 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  33.04 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  30.91 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  31.53 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  31.11 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  27.08 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  27.08 
 
 		 294 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  31.22 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  29.55 
 
 		 295 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  30.59 
 
 		 298 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  30.77 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  30.77 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.55 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  30.77 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  25.73 
 
 		 305 aa  99.4  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  29.2 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  26.39 
 
 		 302 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  25.52 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  29.66 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  24.66 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  27.72 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  27.9 
 
 		 293 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.63 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  23.7 
 
 		 296 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  24.03 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  23.7 
 
 		 296 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  23.7 
 
 		 296 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3677  RarD protein, DMT superfamily transporter  31.34 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  28.88 
 
 		 306 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.97 
 
 		 306 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00198  Conserved membrane protein RarD  27.78 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.58 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  22.6 
 
 		 309 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  22.95 
 
 		 309 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  22.85 
 
 		 302 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  22.85 
 
 		 302 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.21 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  26.59 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  23.46 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  24.69 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  25.17 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.62 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  25.62 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  24.15 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  27.05 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  19.93 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  24.45 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>