228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0947 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0947  transporter DMT superfamily protein  100 
 
 		 302 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0982  transporter DMT superfamily protein  100 
 
 		 302 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2916  RarD protein  47.77 
 
 		 293 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3162  transporter DMT superfamily protein  44.14 
 
 		 294 aa  225  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3436  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.55 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.509712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2327  transporter DMT superfamily protein  45.21 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3361  RarD protein  43.45 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0796601  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2500  transporter DMT superfamily protein  46.29 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2437  transporter DMT superfamily protein  44.86 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3591  rarD protein  43.1 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4122  transporter DMT superfamily protein  40.22 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7043  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.11 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497948  normal  0.0116084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5313  rarD protein  38.6 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5547  transporter DMT superfamily protein  38.6 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1360  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.07 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0549521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2500  transporter DMT superfamily protein  39.72 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  0.016455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4725  transporter DMT superfamily protein  38.25 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0025  RarD protein  38.57 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0111  RarD protein  38.68 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4871  transporter DMT superfamily protein  39.51 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1302  transporter DMT superfamily protein  38.35 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5418  transporter DMT superfamily protein  38.6 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3259  transporter DMT superfamily protein  39.3 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0786612 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1956  rarD protein  38.51 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.435358  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1278  rarD protein  38.51 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1260  rarD protein  38.51 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2921  RarD protein  38.51 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.037743  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2234  RarD protein  38.51 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0973  rarD protein  38.18 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1849  transporter DMT superfamily protein  32.67 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2239  rarD protein  39.25 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0151  RarD protein  31.51 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3046  RarD protein  38.18 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1944  RarD protein  35.64 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0357  rarD protein  31.29 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0687634 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1723  rarD protein  35 
 
 		 356 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.404594  normal  0.849801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19160  hypothetical protein  33.7 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.552283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1653  hypothetical protein  34.42 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2440  rarD protein  31.71 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  29.39 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  31.06 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  29.63 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  27.99 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  27.99 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  27.99 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  27.18 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  25.68 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  25.67 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000278  RarD protein  28.15 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  28.14 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.14 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  28.14 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  28.14 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  28.14 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  28.14 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  28.14 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  27.95 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  28.14 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  25.91 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.55 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  26.1 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  25.86 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  25.42 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  26.1 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  26.1 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  26.1 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05888  hypothetical protein  28.24 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  26.94 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  26.1 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.86 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  24.83 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  26.6 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2968  RarD protein  25.44 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  26.51 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  26.32 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  26.42 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  26.42 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  23.66 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  24.14 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  25.43 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  24.82 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  23.33 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  23.33 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  23.33 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  23.33 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  23.33 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  25 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.93 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  24.66 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  22.98 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  23.93 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.24 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  23.59 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  26.24 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  26.24 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  26.24 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  23.93 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  25.18 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  24.48 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1118  rarD protein  24.65 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>