217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0151 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0151  RarD protein  100 
 
 		 295 aa  580  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1944  RarD protein  67.47 
 
 		 294 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000444417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3162  transporter DMT superfamily protein  34.15 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2916  RarD protein  33.22 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3436  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.66 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.509712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2437  transporter DMT superfamily protein  30.14 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2327  transporter DMT superfamily protein  29.79 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0982  transporter DMT superfamily protein  31.51 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0947  transporter DMT superfamily protein  31.51 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2500  transporter DMT superfamily protein  29.5 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3361  RarD protein  30.3 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0796601  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7043  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.22 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497948  normal  0.0116084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3591  rarD protein  31.47 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2500  transporter DMT superfamily protein  29.51 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  0.016455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1360  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.51 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0549521  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4122  transporter DMT superfamily protein  29.58 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0025  RarD protein  28.92 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1849  transporter DMT superfamily protein  25.85 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5313  rarD protein  30.2 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5547  transporter DMT superfamily protein  30.2 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0111  RarD protein  29.8 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1302  transporter DMT superfamily protein  25 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4725  transporter DMT superfamily protein  29.39 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0357  rarD protein  26.17 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0687634 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5418  transporter DMT superfamily protein  30.61 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4871  transporter DMT superfamily protein  30.2 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1723  rarD protein  27.54 
 
 		 356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.404594  normal  0.849801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19160  hypothetical protein  28.98 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.552283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3259  transporter DMT superfamily protein  29.8 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0786612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1653  hypothetical protein  28.96 
 
 		 311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2440  rarD protein  28.36 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12249  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1956  rarD protein  30.61 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.435358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1260  rarD protein  30.61 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2234  RarD protein  30.61 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1278  rarD protein  30.61 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2921  RarD protein  30.61 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.037743  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0973  rarD protein  30.2 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2239  rarD protein  29.92 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3046  RarD protein  30.61 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  27.27 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.37 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  22.76 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  26.52 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  26.25 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  27.31 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  27.31 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  27.1 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  25.51 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  25.1 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  25.6 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0680  rarD protein  25.19 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  26.15 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  26.21 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0672  RarD protein  23.47 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0152  RarD protein  26.79 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.886029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  22.1 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  22.1 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  22.1 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  22.1 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  22.1 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  22.1 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  22.1 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  22.1 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  22.02 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  22.38 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  21.74 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  24.54 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  25.09 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  22.38 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  23.97 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  25.54 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  23.05 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  26.27 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  26.27 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  26.52 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  21.93 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  25.85 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  23.97 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  27.34 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0508  permease  23.66 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.057497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  25.11 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  24.03 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  22.67 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  25.42 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  22.03 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  26 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  26 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  22.62 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0796  RarD protein  26.75 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000337641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  20.78 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  24.12 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  21.43 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  25.22 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.22 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  24.15 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  26.34 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  25.22 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1952  rarD protein  21.43 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  25.22 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  25.22 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>