215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1427 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 
235 aa  483  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  82.55 
 
 
235 aa  409  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  66.53 
 
 
234 aa  328  5.0000000000000004e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  62.55 
 
 
233 aa  315  3e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  61.47 
 
 
232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  61.04 
 
 
232 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  59.74 
 
 
232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  59.15 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  48.9 
 
 
240 aa  250  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  37.45 
 
 
229 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  39.52 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  37.8 
 
 
230 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  36 
 
 
225 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  37.44 
 
 
229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  33.91 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  35.12 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  32.91 
 
 
229 aa  125  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  33.61 
 
 
229 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
238 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  37.17 
 
 
229 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  33.19 
 
 
221 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  36.87 
 
 
229 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  35.79 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  38.5 
 
 
232 aa  118  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  32.37 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  34.42 
 
 
239 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  31.2 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  28.64 
 
 
232 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  31.89 
 
 
223 aa  106  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  32.71 
 
 
237 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  33.5 
 
 
232 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  31.36 
 
 
235 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  29.33 
 
 
230 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  27.5 
 
 
240 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  31.49 
 
 
240 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  33.49 
 
 
238 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  28.95 
 
 
225 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  29.15 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  31.94 
 
 
239 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  33.71 
 
 
236 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  32.09 
 
 
236 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  31.07 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  33.71 
 
 
235 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  33.71 
 
 
235 aa  99  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  28.33 
 
 
237 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  31.75 
 
 
236 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  31.16 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  29.63 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  27.92 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  29.36 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  28.95 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  28.02 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  31.66 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  28.51 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  29.24 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  28.15 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  30.15 
 
 
252 aa  95.5  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  29.69 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  30.15 
 
 
252 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  28.69 
 
 
255 aa  95.1  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  31.65 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  32.09 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  31.38 
 
 
259 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  30.28 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 
222 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  28.33 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  31.02 
 
 
229 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  29.2 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  28.33 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  25.97 
 
 
226 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 
240 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  29.79 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  30.04 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  29.39 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  31.5 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  27.07 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  29.9 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  29.49 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  29.9 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  30.85 
 
 
246 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  30.12 
 
 
238 aa  92.8  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  29.89 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  31.84 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  26.52 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  29.9 
 
 
250 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  27.93 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  32 
 
 
230 aa  92  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  28.9 
 
 
252 aa  92  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  29.63 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  29.63 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>