49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0281 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  297  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  38.46 
 
 		 435 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  34.51 
 
 		 527 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  31.06 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  32.19 
 
 		 335 aa  62  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  46.84 
 
 		 436 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  31.39 
 
 		 594 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  31.54 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  32.69 
 
 		 769 aa  57.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  42.31 
 
 		 449 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  36.84 
 
 		 427 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  30.32 
 
 		 1316 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  39.13 
 
 		 1409 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  30.57 
 
 		 385 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  39.13 
 
 		 919 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  30.46 
 
 		 512 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  31.17 
 
 		 462 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  28.14 
 
 		 365 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  31.41 
 
 		 397 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  26.11 
 
 		 392 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  31.71 
 
 		 351 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  31.36 
 
 		 486 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  39.19 
 
 		 730 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  38.46 
 
 		 456 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  27.1 
 
 		 374 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  40 
 
 		 522 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  29.11 
 
 		 405 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  30.52 
 
 		 317 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  25.61 
 
 		 374 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  25.93 
 
 		 402 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  29.93 
 
 		 327 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  30.14 
 
 		 365 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  32.05 
 
 		 374 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  28.39 
 
 		 374 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  27.63 
 
 		 327 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  31.58 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30.07 
 
 		 482 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  34.25 
 
 		 376 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  37.14 
 
 		 375 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  30.26 
 
 		 374 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  29.29 
 
 		 368 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  32.05 
 
 		 922 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  36.23 
 
 		 375 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  29.14 
 
 		 501 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  37.14 
 
 		 427 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  24.02 
 
 		 504 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  27.68 
 
 		 505 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  47.37 
 
 		 375 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  29.03 
 
 		 543 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>