72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06790 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  44.88 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 806 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 304 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 68 aa  49.7  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3677  hypothetical protein  36.11 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378815  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  28.93 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  32.26 
 
 		 116 aa  47.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  27.5 
 
 		 122 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0972  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 112 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 737 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 800 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40 
 
 		 72 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  30.09 
 
 		 106 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12573  tRNA modification GTPase  42.31 
 
 		 112 aa  45.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  30.86 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 96 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  36.62 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  30.16 
 
 		 127 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  38.33 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 83 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 84 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  27.5 
 
 		 118 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  30.59 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 117 aa  43.5  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  37.29 
 
 		 370 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 69 aa  42.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  32.43 
 
 		 123 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  29.03 
 
 		 121 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 112 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 77 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  32.39 
 
 		 114 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  30.83 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  30.83 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 252 aa  42.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32.39 
 
 		 114 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  30.83 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  30.83 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  30.83 
 
 		 118 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0194  hypothetical protein  40.74 
 
 		 159 aa  42  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.476438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 182 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1970  hypothetical protein  36.62 
 
 		 162 aa  42  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.888665 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  37.29 
 
 		 270 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 67 aa  41.6  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  37.29 
 
 		 181 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 181 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  25 
 
 		 123 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  34.48 
 
 		 105 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 106 aa  41.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  30.65 
 
 		 133 aa  41.2  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  25 
 
 		 123 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 109 aa  40.8  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 176 aa  41.2  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>