28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3919 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2176  hypothetical protein  52.94 
 
 		 198 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03758  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  47.46 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1414  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1448  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  43.08 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  46 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  35.82 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  35 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 181 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>