31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2738 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  283  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  92.91 
 
 		 142 aa  263  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1448  XRE family transcriptional regulator  82.98 
 
 		 142 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1414  XRE family transcriptional regulator  82.98 
 
 		 142 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03758  transcriptional regulator, XRE family  40.88 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  56.36 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  45.88 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  52.73 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  37.72 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2176  hypothetical protein  49.21 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  54 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  57.41 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  34.62 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 406 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2033  transcriptional regulator, putative  38.18 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>