38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1289 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  53.7 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1414  XRE family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1448  XRE family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  49.12 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  43.24 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  52.94 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 231 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  48.94 
 
 		 226 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 231 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 231 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03758  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2176  hypothetical protein  34.29 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  39.62 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 406 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  43.64 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1592  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 217 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>