29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2138 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  473  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  95.67 
 
 		 231 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  78.35 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 231 aa  298  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  48.46 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  58 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  46.03 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  51.72 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1414  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1448  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  46.15 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  56 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  64.58 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2176  hypothetical protein  52.17 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 136 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 112 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03758  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 137 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 91 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 406 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1649  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 80 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  26.96 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  41.38 
 
 		 323 aa  41.6  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>