25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2176 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  55.74 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 112 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  50.79 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 104 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  51.61 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  54 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1414  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1448  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03758  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 137 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 231 aa  52  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  47.83 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 136 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  30.56 
 
 		 233 aa  45.1  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0890  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 77 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>