25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03758 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03758  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1448  XRE family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1414  XRE family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  42.65 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2176  hypothetical protein  39.47 
 
 		 198 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  56 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  49.02 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  52.73 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  44.07 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 231 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 406 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  24.81 
 
 		 217 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>