48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1588 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  298  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2176  hypothetical protein  36.63 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  51.85 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  53.7 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  36.28 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1448  XRE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  54 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1414  XRE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 231 aa  57  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  50.94 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03758  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 231 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  42.37 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  43.64 
 
 		 368 aa  42  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2033  transcriptional regulator, putative  48.78 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  25 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0970  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 273 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>