31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1386 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  51.43 
 
 		 212 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2176  hypothetical protein  30.36 
 
 		 198 aa  70.5  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1448  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1414  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  33.96 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  49.12 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  43.86 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03758  transcriptional regulator, XRE family  30.83 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 158 aa  52  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  36.84 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  35.38 
 
 		 383 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  36.36 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  28.09 
 
 		 304 aa  41.6  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 406 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  28.7 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0890  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>