106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02285 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  323  9e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  35.98 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  36.25 
 
 		 176 aa  94  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  39.62 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  38.46 
 
 		 167 aa  91.3  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  34.57 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  35.19 
 
 		 205 aa  89  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  34.57 
 
 		 201 aa  88.2  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  35.19 
 
 		 203 aa  88.2  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 171 aa  87  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  34.38 
 
 		 220 aa  85.1  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  31.82 
 
 		 210 aa  85.5  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  35.4 
 
 		 208 aa  84  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  34.16 
 
 		 203 aa  84  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  30.25 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  31.65 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.42 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  29.63 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  31.55 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  30.25 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  33.75 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  29.45 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  33.54 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  31.25 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  32.91 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  27.95 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  32.91 
 
 		 215 aa  74.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  29.01 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  30.43 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  32.12 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  31.29 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  35.83 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  30.49 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  29.94 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  31.01 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  31.9 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  31.21 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  34.45 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  30.32 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  29.75 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 		 213 aa  67.4  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0571  small GTP-binding protein  37.75 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000068839  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  32.28 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  28.96 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  30.18 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  30.86 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  29.38 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  29.63 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  28.31 
 
 		 218 aa  63.9  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  34.41 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 		 240 aa  60.8  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  29.19 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  29.19 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  34.41 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  32.5 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  27.03 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  30.06 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  28.66 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  33.68 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  30.58 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  27.65 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  28.98 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  29.46 
 
 		 885 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  31.62 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  29.81 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  30 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  31.01 
 
 		 307 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  26.88 
 
 		 937 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  26.88 
 
 		 937 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  30.36 
 
 		 224 aa  48.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  27.87 
 
 		 191 aa  47.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  27.5 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  25.37 
 
 		 280 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  26.89 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  28.57 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  25.58 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  27.78 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  26.71 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  25 
 
 		 199 aa  45.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  26.09 
 
 		 198 aa  44.7  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.34 
 
 		 1015 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  24.39 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  25.62 
 
 		 925 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  27.96 
 
 		 892 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  25.36 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  28.66 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  23.39 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  23.44 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  28.1 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  26.14 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  24.62 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  32.57 
 
 		 464 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  27.27 
 
 		 1041 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  29.06 
 
 		 185 aa  42  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.121793 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  23.53 
 
 		 230 aa  41.6  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  28.03 
 
 		 296 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  29 
 
 		 761 aa  41.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  24.16 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  26.14 
 
 		 748 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>