295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00035 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00035  putative 50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 177 aa  348  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0424  50S ribosomal protein L10  68.79 
 
 		 171 aa  239  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000721465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1941  50S ribosomal protein L10  58.86 
 
 		 167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0392  50S ribosomal protein L10  51.72 
 
 		 174 aa  181  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0847  ribosomal protein L10  48.57 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  48 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  47.16 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1398  50S ribosomal protein L10  41.34 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  42.22 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1708  ribosomal protein L10  42.41 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0962108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3171  50S ribosomal protein L10  40.13 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  29.14 
 
 		 181 aa  84.3  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  31.46 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  31.07 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  30.19 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  30.43 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  28.09 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  28.09 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  31.43 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  32.45 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  38.36 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  29.94 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  29.94 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  31.87 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  34.1 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  31.07 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  28.41 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  31.48 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  31.48 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  30.86 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  31.48 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  28.41 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  27.22 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  28.74 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  34.9 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  31.25 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  33.76 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  28.74 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  31.33 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  28.3 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  28.41 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  28.16 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  34.18 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  28 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  29.17 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  29.09 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  29.34 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  30.67 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  27.93 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  30.86 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  29.31 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  24.14 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  28.16 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  29.55 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02221  50S ribosomal protein L10  30.68 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  32.45 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  23.84 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  27.68 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  29.14 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  27.12 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  27.27 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  31.64 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  29.31 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  29.78 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  28.98 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0357  50S ribosomal protein L10  23.6 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.395491  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  33.09 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  28.16 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  28.16 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0204  50S ribosomal protein L10  30.11 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  25.84 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  25.84 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  29.7 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  29.7 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  27.59 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02201  50S ribosomal protein L10  29.55 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.825352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  27.01 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  27.59 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  28.65 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  26.44 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  27.54 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  25.97 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  28.65 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  27.7 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  27.68 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  27.75 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>