56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0447 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0447  putative type IV secretion system protein VirB1  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0160  Lytic transglycosylase catalytic  64.76 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4203  lytic transglycosylase catalytic  64.37 
 
 		 215 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4854  lytic transglycosylase, catalytic  55.81 
 
 		 215 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3312  lytic transglycosylase, catalytic  55.81 
 
 		 215 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1753  putative type IV secretion system protein VirB1  64.29 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6507  Lytic transglycosylase catalytic  56.71 
 
 		 215 aa  207  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2658  putative conjugal transfer protein, VirB1/TraA like  67.31 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0069  type IV secretion system protein VirB1  57.06 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0063  type IV secretion system protein VirB1  57.06 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6321  lytic transglycosylase catalytic  55.49 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3753  lytic transglycosylase catalytic  53.8 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468615  hitchhiker  0.00223581 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3525  lytic transglycosylase, catalytic  54.34 
 
 		 262 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5443  lytic transglycosylase catalytic  54.34 
 
 		 262 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297116  normal  0.0393072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4841  lytic transglycosylase, catalytic  54.34 
 
 		 262 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00117575  hitchhiker  0.00476271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4216  lytic transglycosylase, catalytic  54.97 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4738  lytic transglycosylase catalytic  56.02 
 
 		 267 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  46.73 
 
 		 217 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0873  lytic transglycosylase catalytic  47.77 
 
 		 169 aa  138  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  45.75 
 
 		 181 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1609  Lytic transglycosylase catalytic  44.23 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  44.87 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  33.79 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0104  pilx1 protein  34.76 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718662 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5010  lytic transglycosylase, catalytic  42.59 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.129751 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3520  lytic transglycosylase, catalytic  42.07 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.940795  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  34.15 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1133  Lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0009  conjugal transfer protein  33.53 
 
 		 203 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.461383  normal  0.692739 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0033  conjugal transfer protein  35.07 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4349  lytic transglycosylase, catalytic  36.31 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02998  hypothetical protein  33.1 
 
 		 316 aa  92.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0035  pilx1 protein  30.36 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08216  conjugal transfer protein TraB  32.87 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2494  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7344  Lytic transglycosylase catalytic  38.06 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8227  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  36.99 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998898  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6162  type IV secretion system lytic transglycosylase VirB1  37.33 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0261  Lytic transglycosylase catalytic  41.35 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.385484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1698  conjugal transfer -like protein  36.55 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1397  Lytic transglycosylase catalytic  36.55 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4928  transport secretion system IV protein, VirB1  34.88 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6492  transport secretion system IV protein, VirB1  36.81 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733642  normal  0.924712 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  36.08 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  32.65 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0674  virB1 type IV secretion protein  31.06 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  34.86 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  38 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0258  Type IV secretory pathway AvhB1 protein  42 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1591  conjugal transfer protein  26.03 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0975326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  27.52 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  27.27 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  28.39 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2906  lytic transglycosylase, catalytic  28.37 
 
 		 306 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0327296  normal  0.0416217 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 140 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  26.72 
 
 		 179 aa  41.6  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>