More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1317 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  100 
 
 
288 aa  591  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.28 
 
 
288 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.78 
 
 
288 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.18 
 
 
286 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.05 
 
 
285 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.34 
 
 
285 aa  427  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.99 
 
 
286 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.99 
 
 
285 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.63 
 
 
285 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.23 
 
 
285 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  70.32 
 
 
285 aa  418  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.02 
 
 
286 aa  411  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.12 
 
 
285 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.12 
 
 
285 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.42 
 
 
285 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.14 
 
 
300 aa  401  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.73 
 
 
286 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
286 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.37 
 
 
286 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.02 
 
 
285 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.96 
 
 
285 aa  391  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.14 
 
 
285 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.38 
 
 
292 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.02 
 
 
285 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.34 
 
 
286 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.86 
 
 
285 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.16 
 
 
280 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  64.18 
 
 
286 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.83 
 
 
285 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798039  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.03 
 
 
311 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.54 
 
 
285 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.612253  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.89 
 
 
285 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.16 
 
 
285 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.89 
 
 
288 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.7 
 
 
285 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.17 
 
 
290 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.03 
 
 
298 aa  353  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.82 
 
 
290 aa  353  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0102101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.82 
 
 
290 aa  352  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.424888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.89 
 
 
291 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791141  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.48 
 
 
295 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.84 
 
 
295 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.78 
 
 
295 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.48 
 
 
308 aa  342  5e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
292 aa  341  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.082877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.95 
 
 
293 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.54 
 
 
297 aa  323  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.06 
 
 
304 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.51 
 
 
298 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.38 
 
 
293 aa  318  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 
285 aa  316  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.31 
 
 
285 aa  315  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.43 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752467  normal  0.0103168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  54.06 
 
 
286 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  53.21 
 
 
288 aa  308  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  53.21 
 
 
288 aa  308  9e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.67 
 
 
284 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  57.04 
 
 
297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.75 
 
 
335 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  52.14 
 
 
288 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  53.57 
 
 
288 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 
288 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 
288 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 
288 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 
288 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  50.7 
 
 
291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 
288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  52.14 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  52.86 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.26 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.07 
 
 
293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.79 
 
 
287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.96 
 
 
297 aa  301  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.26 
 
 
288 aa  301  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
287 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.9 
 
 
333 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828162  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.39 
 
 
306 aa  299  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
286 aa  298  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
286 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.43 
 
 
335 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.43 
 
 
335 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  49.13 
 
 
286 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 
284 aa  294  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.28 
 
 
285 aa  294  9e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.82 
 
 
296 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.83 
 
 
285 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17140  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  54.15 
 
 
307 aa  291  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391545  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  54.85 
 
 
306 aa  291  9e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.64 
 
 
301 aa  291  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.35 
 
 
286 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.13 
 
 
297 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15410  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  53.79 
 
 
313 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.79 
 
 
285 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.79 
 
 
285 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.110576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.43 
 
 
285 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.05 
 
 
299 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.87 
 
 
335 aa  288  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000556089  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.69 
 
 
284 aa  288  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.42 
 
 
284 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.757824  normal  0.126466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>