More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0676 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2302  sigma-54 dependent transcriptional regulator  72.83 
 
 
449 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2283  sigma-54 dependent transcriptional regulator  73.38 
 
 
451 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2115  putative sensory box sigma-54 dependent transcriptional regulator  73.05 
 
 
467 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0676  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  100 
 
 
456 aa  916    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2171  putative sensory box sigma-54 dependent transcriptional regulator  73.15 
 
 
469 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5042  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  70.61 
 
 
460 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1668  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  70.7 
 
 
465 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.126097  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1760  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  69.67 
 
 
460 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6335  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  69.45 
 
 
460 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1744  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  69.45 
 
 
460 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1665  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  69.87 
 
 
465 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1516  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  70.35 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3590  helix-turn-helix, Fis-type  67.65 
 
 
436 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5349  transcriptional regulator  68.03 
 
 
441 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.982253  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0111  sigma-54 dependent transcriptional regulator  63.09 
 
 
439 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0077  helix-turn-helix, Fis-type  63.76 
 
 
439 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0070  putative sigma54 specific transcriptional regulator  64.29 
 
 
434 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.000000158676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0067  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  64.07 
 
 
430 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0051  sigma-54 dependent transcriptional regulator  64.07 
 
 
430 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000634616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0067  putative sigma54 specific transcriptional regulator  64.99 
 
 
430 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485042  hitchhiker  0.00677229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2020  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  55.3 
 
 
466 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0682  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  54.39 
 
 
441 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2820  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  51 
 
 
452 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287176  hitchhiker  0.0000171057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3553  putative sigma54 specific transcriptional regulator  53.51 
 
 
441 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0682  helix-turn-helix, Fis-type  53.08 
 
 
454 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0164  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  52.22 
 
 
450 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.342124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0146  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  52.43 
 
 
459 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.742059 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2043  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.35 
 
 
439 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.339367  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2356  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  50.57 
 
 
436 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0870  putative PAS/PAC sensor protein  46.41 
 
 
469 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.252306 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1072  putative sigma54 specific transcriptional regulator  49 
 
 
451 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03806  sigma-54 dependent transcriptional regulator  45.66 
 
 
440 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0957  sigma-54 dependent transcriptional regulator  49 
 
 
451 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1976  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family protein  42.19 
 
 
438 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1665  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  48.16 
 
 
467 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1875  sigma-54 dependent transcriptional regulator  43.55 
 
 
434 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2226  putative sigma54 specific transcriptional regulator  41.94 
 
 
439 aa  326  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2597  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  41.94 
 
 
439 aa  326  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2227  Fis family transcriptional regulator  40.58 
 
 
430 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.494043  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.54 
 
 
470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2065  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.08 
 
 
557 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461266  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0358  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.28 
 
 
446 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0751  transcriptional regulator  36.81 
 
 
444 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.894725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0168  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.42 
 
 
462 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2158  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.62 
 
 
453 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1544  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.62 
 
 
568 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.69 
 
 
473 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2865  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.27 
 
 
553 aa  253  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0882219  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2084  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  42.73 
 
 
477 aa  253  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.327808  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3727  Fis family transcriptional regulator  41.54 
 
 
342 aa  252  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1032  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.03 
 
 
461 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2842  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.27 
 
 
553 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000148111 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2645  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.27 
 
 
553 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2561  sigma-54-dependent transcriptional activator  41.27 
 
 
553 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.69 
 
 
473 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.69 
 
 
473 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2836  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.27 
 
 
553 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0181169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2887  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.27 
 
 
553 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2639  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  40.95 
 
 
553 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.017271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1698  helix-turn-helix, Fis-type  43.15 
 
 
540 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2445  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.27 
 
 
553 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210628  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3091  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.69 
 
 
456 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.416346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1748  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  41.03 
 
 
542 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1028  response regulator receiver protein  46.06 
 
 
439 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163891  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1125  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.97 
 
 
458 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3196  Fis family transcriptional regulator  39.13 
 
 
494 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2596  sigma-54-dependent transcriptional activator  40.95 
 
 
553 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.491073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2848  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.08 
 
 
553 aa  249  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0615513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.45 
 
 
468 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428008  normal  0.0222917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3191  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.82 
 
 
456 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.03 
 
 
470 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3284  putative transcriptional regulator  37.08 
 
 
481 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2001  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49 
 
 
482 aa  247  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2362  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.37 
 
 
479 aa  247  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1977  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.23 
 
 
447 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0220  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.43 
 
 
599 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205881  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.65 
 
 
582 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2109  Fis family transcriptional regulator  42.81 
 
 
473 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0356  putative two component response regulator  41.84 
 
 
492 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.95 
 
 
467 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.96 
 
 
463 aa  246  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.03 
 
 
515 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3062  two-component response regulator CbrB  42.74 
 
 
463 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1563  Fis family transcriptional regulator  43.73 
 
 
348 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.356277 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.32 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02226  sigma-54 interacting response regulator transcription regulator protein  39.84 
 
 
491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.77 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0447  putative sigma54 specific transcriptional regulator  36.19 
 
 
438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4808  two-component response regulator CbrB  42.55 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069592  hitchhiker  0.0095877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5443  two-component response regulator CbrB  43.52 
 
 
477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3285  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.61 
 
 
456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3274  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.35 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156688  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38570  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 
456 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1549  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62540  two-component response regulator CbrB  43.15 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349279  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.06 
 
 
458 aa  244  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2041  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  44.16 
 
 
455 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.01 
 
 
469 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0792  hypothetical protein  32.8 
 
 
662 aa  244  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2554  type 4 fimbriae expression regulatory protein PilR  43.53 
 
 
452 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0915  transcriptional regulator FleQ  42.81 
 
 
471 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>