176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0216 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  100 
 
 
266 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  93.44 
 
 
259 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  78.52 
 
 
270 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  44.35 
 
 
254 aa  216  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  45.11 
 
 
245 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  47.62 
 
 
235 aa  216  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  48.05 
 
 
239 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  43.21 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  42.44 
 
 
292 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  37.2 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  38.25 
 
 
257 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  39.02 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  40.65 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  31.67 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  36.1 
 
 
229 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  32.26 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1575  polyphosphate glucokinase  38.14 
 
 
236 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  30.8 
 
 
282 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  33.2 
 
 
260 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  32.53 
 
 
245 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  34.42 
 
 
255 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  32.37 
 
 
266 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  31.84 
 
 
267 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  30.5 
 
 
255 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  32.38 
 
 
244 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  29.12 
 
 
257 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  31.23 
 
 
255 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  30.49 
 
 
281 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  32.79 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  30.8 
 
 
253 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  31.22 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  34.24 
 
 
270 aa  98.6  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  30.17 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7569  hypothetical protein  35.65 
 
 
226 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  32 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  29.84 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  31.33 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  31.47 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  31.97 
 
 
254 aa  92  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  32.38 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  31.76 
 
 
258 aa  89  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  28.84 
 
 
274 aa  88.6  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  33.74 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  31.11 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  31.11 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  31.11 
 
 
269 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  29.73 
 
 
271 aa  85.9  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  33.2 
 
 
248 aa  85.9  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  29.17 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  29.22 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  30.74 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  31.25 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  29.51 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  29.96 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  32.26 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.13 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.07 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3704  N-acetylmannosamine kinase  38.58 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.338423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3554  N-acetylmannosamine kinase  40.71 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03082  N-acetylmannosamine kinase  39.82 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0484  ROK familiy protein  39.82 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0484  N-acetylmannosamine kinase  39.82 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03033  hypothetical protein  39.82 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3517  N-acetylmannosamine kinase  38.58 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4539  N-acetylmannosamine kinase  39.82 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524903  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3659  N-acetylmannosamine kinase  38.05 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3410  N-acetylmannosamine kinase  39.82 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  33.76 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1173  ROK domain-containing protein  34.85 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  31.08 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  30 
 
 
314 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  25.67 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.73 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  35.65 
 
 
323 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.73 
 
 
297 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.73 
 
 
297 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  33.33 
 
 
352 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  32.43 
 
 
342 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  31.51 
 
 
292 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  29.17 
 
 
316 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  29.48 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  29.61 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.43 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  33.12 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3599  N-acetylmannosamine kinase  33.63 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3634  N-acetylmannosamine kinase  33.63 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3529  N-acetylmannosamine kinase  33.63 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3527  N-acetylmannosamine kinase  33.63 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3696  N-acetylmannosamine kinase  33.63 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  30.14 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  33.33 
 
 
363 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  29.95 
 
 
332 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  31.13 
 
 
354 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  29.45 
 
 
292 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  25.68 
 
 
363 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  30.14 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0118  ROK family protein  26.79 
 
 
350 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  33.33 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  30.14 
 
 
292 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  30.73 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.437029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>