More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0069 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 384 aa  787    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  58.51 
 
 		 384 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  52.02 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  54.91 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  52.13 
 
 		 386 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  54.64 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  49.6 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  54.01 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  50.27 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.6 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  49.21 
 
 		 398 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  48.18 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.07 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  49.21 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  50.4 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  47.45 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.7 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.38 
 
 		 396 aa  359  5e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  49.34 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.93 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.34 
 
 		 398 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  47.48 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  49.87 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  48.13 
 
 		 402 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  51.34 
 
 		 390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  46.98 
 
 		 387 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  46.98 
 
 		 387 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.72 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  46.98 
 
 		 387 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  46.46 
 
 		 387 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  47.59 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  46.46 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  45.31 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  46.19 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  48.94 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.48 
 
 		 401 aa  346  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.76 
 
 		 401 aa  346  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  46.15 
 
 		 390 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  46.4 
 
 		 389 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  48.03 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  48.04 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  48.03 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.49 
 
 		 401 aa  344  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  48.81 
 
 		 390 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.05 
 
 		 397 aa  342  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  46.15 
 
 		 387 aa  342  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48.01 
 
 		 388 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  47.76 
 
 		 388 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  51.48 
 
 		 385 aa  342  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  46.44 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  49.19 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  49.74 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.33 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  47.71 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  48.15 
 
 		 394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  47.23 
 
 		 388 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  45.72 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  45.62 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  45.72 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  46.24 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  45.72 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  47.77 
 
 		 391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  45.72 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  45.58 
 
 		 388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  47.86 
 
 		 390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  46.65 
 
 		 376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  45.91 
 
 		 395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.16 
 
 		 415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.16 
 
 		 415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  45.99 
 
 		 394 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  48.02 
 
 		 396 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  45.99 
 
 		 394 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  45.72 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  45.72 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.72 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  45.72 
 
 		 396 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  45.72 
 
 		 396 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  45.72 
 
 		 396 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  45.72 
 
 		 396 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  45.89 
 
 		 425 aa  335  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  46.28 
 
 		 382 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  46.58 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.24 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  45.99 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  47.57 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  49.48 
 
 		 402 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  46.48 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  46.48 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  46.48 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  45.95 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  48.21 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  48.03 
 
 		 394 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47.24 
 
 		 399 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  45.82 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  46.23 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  47.26 
 
 		 392 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  44.09 
 
 		 379 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  46.88 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  46.54 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>