147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4338 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  89.07 
 
 		 302 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  62.42 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  39.41 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  33.56 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  36.15 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  35.02 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  31.25 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  32.44 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  31.19 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  32.43 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  31.76 
 
 		 353 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  33.56 
 
 		 357 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  33.56 
 
 		 357 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  33.56 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  33.56 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  33.56 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  33.56 
 
 		 357 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  34.38 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  31.42 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  31.42 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  33.22 
 
 		 357 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  32.54 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  30.34 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  33.45 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  32.08 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  29.53 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  32.55 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  31.97 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  30.72 
 
 		 353 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  32.19 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  30.72 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  31.13 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  33.67 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  29.69 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  31.53 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  30.3 
 
 		 295 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  31.1 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  29.41 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  30.87 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  36.3 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  29.07 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  29.56 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  28.67 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  29.2 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  29.39 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5533  Aldose 1-epimerase  27.85 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  29.44 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  29.09 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  29.09 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  29.09 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  29.09 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  29.09 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  29.09 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  28.73 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  28.63 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  29.43 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  30.26 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  29.32 
 
 		 336 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  29.25 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  26.55 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  29.31 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  28.98 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  29.48 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  27.64 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  23.77 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  26.87 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  28.57 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  26.53 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  21.58 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  23.41 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4362  aldose 1-epimerase family protein  23.84 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  26.62 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  36.21 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  21.16 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  34.26 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4134  aldose 1-epimerase  23.49 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  31.36 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  24.79 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  26.04 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  22.86 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  25.1 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  25.1 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  26.26 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  26.26 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  30.36 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  26.26 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  24.89 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4109  aldose 1-epimerase family protein  23.84 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0163943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  22.22 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  31.48 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  25 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  25.1 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  28.7 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  24.91 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  31.09 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  32.71 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  30.95 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  30.95 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>