More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3995 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  92.06 
 
 		 193 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  78.19 
 
 		 189 aa  309  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  70.37 
 
 		 192 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  76.16 
 
 		 192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  76.61 
 
 		 192 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  69.89 
 
 		 193 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  69.89 
 
 		 193 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  69.89 
 
 		 193 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  68.78 
 
 		 193 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  69.32 
 
 		 193 aa  260  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  69.32 
 
 		 195 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  68.97 
 
 		 211 aa  259  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  67.2 
 
 		 192 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  69.77 
 
 		 187 aa  256  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  69.19 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  69.19 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  70.24 
 
 		 187 aa  256  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  69.19 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  69.19 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  69.19 
 
 		 187 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  69.19 
 
 		 187 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  64.74 
 
 		 196 aa  239  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  64.88 
 
 		 198 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  63.69 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  63.1 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  62.72 
 
 		 196 aa  235  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  47.62 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  46.43 
 
 		 192 aa  167  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  45.74 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  45.93 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  41.21 
 
 		 196 aa  154  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  49.31 
 
 		 192 aa  150  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  43.45 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  46.98 
 
 		 151 aa  148  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  41.85 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  39.76 
 
 		 191 aa  141  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  39.53 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  36.17 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  36.75 
 
 		 211 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  39.56 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  37.35 
 
 		 198 aa  131  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  40.41 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  36.31 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  33.7 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  33.7 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  33.7 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  41.76 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  38.51 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  33.72 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  33.53 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  38.24 
 
 		 237 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  37.65 
 
 		 237 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  34.05 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  35.84 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  34.05 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.88 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  34.36 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  35.23 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  33.93 
 
 		 212 aa  101  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  40.14 
 
 		 199 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  36.67 
 
 		 201 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  35.26 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  34.29 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  38.1 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  33.55 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  36.94 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.18 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  38.61 
 
 		 214 aa  97.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  35.37 
 
 		 195 aa  98.2  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  35.09 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  32.95 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  32.95 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  37.84 
 
 		 177 aa  96.3  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  37.16 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  33.11 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  35.26 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  33.33 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  32.95 
 
 		 201 aa  95.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  36.02 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  38.82 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  38.82 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  38.82 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  35.33 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  35.06 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  35.06 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  35.84 
 
 		 254 aa  92.8  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  33.55 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  36.73 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  35.62 
 
 		 178 aa  91.7  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  35.33 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  33.91 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  33.96 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  33.72 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  36.99 
 
 		 235 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  40.48 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  33.73 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  33.78 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  35.03 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>