194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2830 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  82.67 
 
 		 262 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  64.19 
 
 		 228 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  55.07 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  56.65 
 
 		 240 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  56.65 
 
 		 240 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  56.65 
 
 		 240 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  56.65 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  56.65 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  56.65 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  50.22 
 
 		 260 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  49.33 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  49.33 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  49.33 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  48.89 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  49.33 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  32.39 
 
 		 266 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  32.39 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  31.98 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  34.38 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  34.38 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  34.38 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  34.38 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  34.38 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  34.38 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  34.38 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  36.31 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  32.26 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  31.48 
 
 		 263 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  36.81 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0119  hypothetical protein  25.85 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.98 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  30.59 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  31.28 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  29.2 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.28 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28.28 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.12 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  32.2 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.07 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.69 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  31.58 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  30.95 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  32.24 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.89 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  29.49 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  28.25 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  30.64 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  28.8 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  29.94 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  29.08 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.49 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  26.98 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  37.33 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  28.7 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  24.55 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  29.85 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0103  hypothetical protein  21.24 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  26.48 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0106  hypothetical protein  23.43 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  33.81 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.69 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  32.98 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.98 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  28.49 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  29.69 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  27.05 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  26.67 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.12 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  31.39 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  30.99 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  30.99 
 
 		 282 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  25.99 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  31.97 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  33.85 
 
 		 280 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  31.28 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.94 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  34.95 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  27.15 
 
 		 251 aa  52  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  22.22 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  30.81 
 
 		 259 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  27.82 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  31.78 
 
 		 336 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  27.54 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  33.11 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  27.53 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  32.58 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.16 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  32.73 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.73 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  32.43 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  28 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1939  hypothetical protein  37.5 
 
 		 335 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  35.44 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  29.78 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  27.61 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  27.61 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>