More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1127 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  100 
 
 
236 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  54.74 
 
 
234 aa  266  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  42.36 
 
 
231 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  46.05 
 
 
233 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  42.86 
 
 
235 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  37.89 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  37.78 
 
 
411 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  39.47 
 
 
407 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  39.04 
 
 
407 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  36.61 
 
 
250 aa  158  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  39.73 
 
 
408 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  40.65 
 
 
232 aa  155  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  36.89 
 
 
410 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  37.23 
 
 
232 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  37.05 
 
 
232 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  36.96 
 
 
232 aa  148  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  36 
 
 
433 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  36.12 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  37.1 
 
 
415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  35.56 
 
 
409 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  35.53 
 
 
236 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 
409 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  37.85 
 
 
232 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  36.04 
 
 
413 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 
409 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 
415 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  36.04 
 
 
413 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  35.81 
 
 
230 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  40.99 
 
 
235 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  36.28 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  36.28 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  36.28 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  36.28 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  36.28 
 
 
230 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  37.38 
 
 
232 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 
415 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 
415 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  38.14 
 
 
230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  37.21 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  37.21 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  37.21 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  37.21 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  37.21 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  37.21 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  37.21 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  35.81 
 
 
230 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  35.4 
 
 
236 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  37.28 
 
 
227 aa  121  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  35.12 
 
 
234 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  35.59 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  36.68 
 
 
229 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  34.96 
 
 
248 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 
229 aa  111  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  34.93 
 
 
234 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  36.84 
 
 
229 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  30.13 
 
 
232 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 
229 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 
229 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  32.75 
 
 
222 aa  98.6  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  37.34 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.33 
 
 
251 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  31.84 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 
229 aa  91.7  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  30.9 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  30.4 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.74 
 
 
261 aa  88.6  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  31.49 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  32.3 
 
 
278 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  28.21 
 
 
251 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  32.13 
 
 
299 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  30.45 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  31.3 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  30.57 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24560  dienelactone hydrolase-like enzyme  32.23 
 
 
249 aa  85.5  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.278572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  29.69 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  30.05 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  28.63 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.93 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  32.26 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  29.79 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.7 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  29.52 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  25.73 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  30.04 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  30.14 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  30.19 
 
 
297 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.26 
 
 
290 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  30.19 
 
 
297 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.26 
 
 
290 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  29.15 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  29.15 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  27.54 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  29.73 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  28.07 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>