More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1099 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  100 
 
 
461 aa  920    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  62.53 
 
 
454 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  61.22 
 
 
454 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  61.98 
 
 
458 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  60.68 
 
 
455 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  61.24 
 
 
439 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  60.78 
 
 
439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  59.25 
 
 
456 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  56.79 
 
 
448 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  53.67 
 
 
450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  53.44 
 
 
450 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  57.77 
 
 
458 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  54.76 
 
 
446 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  50.9 
 
 
452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  50.9 
 
 
452 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  51.11 
 
 
456 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  52.03 
 
 
456 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  55.28 
 
 
455 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  48.18 
 
 
451 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  49.89 
 
 
443 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  47.75 
 
 
445 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  45.35 
 
 
454 aa  388  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  49.29 
 
 
446 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  47.41 
 
 
442 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  47.64 
 
 
440 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  47.17 
 
 
442 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  47.17 
 
 
442 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 
446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  40.22 
 
 
451 aa  323  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  42.57 
 
 
443 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  41.16 
 
 
446 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 
450 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  41.06 
 
 
446 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  34.84 
 
 
452 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  39.76 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  39.76 
 
 
433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  39.27 
 
 
433 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  39.76 
 
 
436 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  39.76 
 
 
433 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  39.02 
 
 
433 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  38.97 
 
 
433 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  39.02 
 
 
436 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  38.78 
 
 
433 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 
435 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  36.94 
 
 
436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  34.11 
 
 
442 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  32.88 
 
 
454 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 
433 aa  223  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  33.71 
 
 
447 aa  222  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.95 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  34.57 
 
 
453 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  33.11 
 
 
452 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  33.11 
 
 
452 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  35.48 
 
 
428 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  34.33 
 
 
453 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  35.57 
 
 
450 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  32.08 
 
 
437 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  33.73 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  31.62 
 
 
475 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  32.39 
 
 
441 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  29.8 
 
 
438 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  32.07 
 
 
449 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  33.1 
 
 
465 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.15 
 
 
461 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  31.56 
 
 
449 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 
451 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  34.03 
 
 
453 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.15 
 
 
454 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  33.8 
 
 
445 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  32.36 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  32.79 
 
 
451 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  32.79 
 
 
451 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  35.73 
 
 
441 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  32.79 
 
 
451 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  32.79 
 
 
451 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  33.18 
 
 
453 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  32.79 
 
 
451 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  33.18 
 
 
453 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  32.79 
 
 
451 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  31.46 
 
 
450 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  32.66 
 
 
453 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  32.79 
 
 
451 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
444 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  32.69 
 
 
448 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  30.82 
 
 
452 aa  192  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  31.9 
 
 
435 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  31.95 
 
 
457 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  30.35 
 
 
452 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  31.84 
 
 
448 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  30.72 
 
 
460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.18 
 
 
465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  32.59 
 
 
454 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  31.46 
 
 
453 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  32.8 
 
 
451 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  32.66 
 
 
449 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  31.84 
 
 
459 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  34.93 
 
 
449 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  31.17 
 
 
448 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  31.7 
 
 
454 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>