More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4364 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4364  amidase  100 
 
 		 471 aa  944    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000480403  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  41.55 
 
 		 467 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  44.29 
 
 		 473 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  44.52 
 
 		 468 aa  286  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  41.46 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.7 
 
 		 463 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.27 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  35.5 
 
 		 456 aa  213  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.78 
 
 		 491 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  36.47 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  36.72 
 
 		 447 aa  207  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  36.75 
 
 		 456 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  32.27 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  37.6 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  37.61 
 
 		 461 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  34.19 
 
 		 464 aa  202  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  33.26 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  36.65 
 
 		 449 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  36.12 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.48 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  33.56 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0782  amidohydrolase, AtzE family  36.15 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0925  amidohydrolase, AtzE family  36.15 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.44 
 
 		 512 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  34.93 
 
 		 449 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  35.43 
 
 		 449 aa  194  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  35.05 
 
 		 440 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1547  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.47 
 
 		 472 aa  193  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460524  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.32 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  33.48 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  34.22 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.74 
 
 		 488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.87 
 
 		 485 aa  190  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.18 
 
 		 481 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.63 
 
 		 485 aa  189  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1499  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.52 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000099116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.96 
 
 		 488 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  36.49 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.21 
 
 		 479 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3243  amidase  34.54 
 
 		 474 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  34.92 
 
 		 453 aa  187  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2341  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.08 
 
 		 485 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  36.12 
 
 		 440 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  32.6 
 
 		 471 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  31.67 
 
 		 470 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.75 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  34.35 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.42 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  31.13 
 
 		 486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  33.18 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  34.27 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.92 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  34.3 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3436  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.03 
 
 		 506 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  33.91 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.39 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.28 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.7 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.58 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  32.33 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5097  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.18 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  34.35 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  31.94 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  32.85 
 
 		 470 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4165  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.9 
 
 		 483 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2368  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  33.33 
 
 		 496 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0836  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.19 
 
 		 483 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0318775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  34.89 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  34.62 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.94 
 
 		 491 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  32.75 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  33.65 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58180  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.76 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4474  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.26 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.78 
 
 		 495 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0184  amidase  35.67 
 
 		 480 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1714  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.2 
 
 		 504 aa  177  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  31.52 
 
 		 451 aa  176  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  36.34 
 
 		 473 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1318  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.45 
 
 		 516 aa  176  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0068  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.35 
 
 		 474 aa  176  9e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  34.42 
 
 		 453 aa  176  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.62 
 
 		 499 aa  176  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  35 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  31.55 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.81 
 
 		 480 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  30.97 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2360  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.02 
 
 		 487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.100992  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.47 
 
 		 498 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.69 
 
 		 483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.63 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  34.85 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0989  amidase  31.22 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  36.34 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8074  Amidase  34.48 
 
 		 496 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2012  amidase  32.6 
 
 		 471 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0494879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.86 
 
 		 486 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  30.32 
 
 		 466 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0118  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.21 
 
 		 485 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.93 
 
 		 485 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>