105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3169 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  72.95 
 
 
209 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  61.58 
 
 
194 aa  215  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  61.71 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  62.07 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  62.43 
 
 
195 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  59.34 
 
 
189 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  57.56 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  55.14 
 
 
192 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  58.48 
 
 
212 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  57.3 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  56.84 
 
 
205 aa  187  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  56.84 
 
 
205 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  57.3 
 
 
205 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  57.3 
 
 
205 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  57.3 
 
 
205 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  57.3 
 
 
205 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  55.73 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  57.61 
 
 
200 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  58.24 
 
 
187 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  56.74 
 
 
200 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  55.98 
 
 
199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  56.91 
 
 
200 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  55.8 
 
 
200 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  55.8 
 
 
200 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  55.8 
 
 
200 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  50.5 
 
 
195 aa  175  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  57.61 
 
 
200 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  53.37 
 
 
191 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  57.3 
 
 
200 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  48.78 
 
 
188 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  48.29 
 
 
188 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  52 
 
 
190 aa  165  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  50 
 
 
195 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  50.88 
 
 
172 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  48 
 
 
177 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  47.73 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  41.18 
 
 
173 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  40.34 
 
 
183 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  38.13 
 
 
173 aa  95.5  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  34.3 
 
 
174 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  35.76 
 
 
174 aa  92  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  41.8 
 
 
174 aa  92.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  39.86 
 
 
176 aa  91.3  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  33.72 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  36.07 
 
 
175 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  35.66 
 
 
194 aa  88.2  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  33.99 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  33.99 
 
 
177 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  33.99 
 
 
181 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  33.99 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  33.99 
 
 
181 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  33.55 
 
 
194 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  38.1 
 
 
176 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  30.67 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  34.84 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  32.92 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  34.51 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.62 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  30.49 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  32.68 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  32.59 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  33.56 
 
 
190 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  32.09 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  29.94 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  27.69 
 
 
276 aa  61.6  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  24.71 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  23.32 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  23.32 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  30.32 
 
 
191 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  32.48 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  32.48 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  30.65 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49960  predicted protein  35.37 
 
 
398 aa  51.6  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49898  predicted protein  34.15 
 
 
810 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  28.5 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  31.82 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.71 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  25 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  31.76 
 
 
209 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 
319 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  29.24 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  31.08 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  32.5 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 
255 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  24.04 
 
 
220 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  36.49 
 
 
225 aa  41.6  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.78 
 
 
255 aa  41.6  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>